Teknologi memungkinkan Anda mendeteksi virus yang belum ditemukan

Teori di sini relatif sederhana, memang benar. Namun, hal yang sama tidak dapat dikatakan tentang teknik yang diperlukan untuk melakukannya. Inilah idenya: Sebuah teknologi baru yang dikembangkan oleh para peneliti di University of Saint Louis mampu mengidentifikasi virus yang belum ditemukan dalam suatu organisme.

Ini adalah aritmatika murni dan sederhana, sebenarnya. Pertama, sampel darah dikumpulkan. Kemudian seluruh urutan genetik manusia dikurangi dari struktur, hanya menyisakan materi virus. Begini cara kerjanya, ketika Anda melihatnya secara terperinci - seperti yang dijelaskan oleh ketua Departemen Penyakit Dalam di institusi tersebut, Adrian Di Bisceglie:

“Kami mengisolasi DNA dan RNA, memperkuat materi genetik dalam darah, melakukan pengurutan yang dalam, dan menggunakan algoritma pencarian untuk menemukan kesamaan dengan semua bit kode yang diketahui, baik dari manusia maupun mikroba. "

Memperkuat sedikit lebih rumit

Seperti yang ditunjukkan oleh peneliti Xiaofeng Fan, sementara prosesnya secara teori mudah dipahami, tantangan besarnya adalah menemukan cara untuk mengevaluasi dengan benar bahan yang tersisa dalam sampel darah - yang diduga dengan kode genetik virus yang dicari.

Ini karena RNA terdegradasi begitu cepat, yang membuat identifikasi oleh sampel darah tidak dapat dilakukan, karena jumlahnya sangat kecil. Namun, dengan memperkuat materi genetik, ukuran yang relatif kecil tidak lagi menjadi penghalang.

Binatang sulit dijinakkan

Saat ini virus tidak menawarkan banyak tantangan bagi komunitas ilmiah. Seperti yang diingat situs web CNET, bahkan ketika infeksi virus dipatenkan, masih ada banyak kesulitan untuk mencari tahu virus spesifik mana yang bertanggung jawab atas kondisi tersebut.

Sampai hari ini, pendekatan standar diperlukan mengumpulkan sampel untuk budidaya laboratorium nanti. Namun, ada batasan yang sangat jelas untuk prosedur ini: orang harus tahu persis virus tempat pendonor materi tersebut. Akhirnya, ada juga masalah waktu - ini adalah prosedur yang relatif panjang.

Namun patut dikatakan: koleksi materi genetik virus bukanlah hal baru. Namun, tidak seperti metode lain, yang disebut "Transkriptom Subtraction" menawarkan keuntungan yang jelas dari bahkan mendeteksi dan mengidentifikasi virus yang masih tidak diketahui umat manusia - karena dimungkinkan untuk membandingkan terhadap urutan genetik yang ada dalam database.

Pengaturan waktu

Teknik "Transkriptom Subtraction" mungkin datang pada waktu yang sangat tepat. Lagipula, saat ini, virus mirip SARS mulai mengkhawatirkan Arab Saudi - ia telah memanen beberapa lusin orang di sana.

Namun, di luar tujuan langsung, para peneliti yang terlibat dengan teknik percaya itu adalah kesempatan unik untuk belajar tentang viroma khas organisme manusia.

"Sama seperti proyek microbiome telah mendaftarkan bakteri yang hidup dan hidup berdampingan di setiap orang, kami juga mempelajari viroma manusia untuk mempelajari lebih lanjut tentang virus yang ada di kita semua, " kata Di Bisceglie. "Kami percaya bahwa tidak semua berbahaya dan bahkan beberapa di antaranya mungkin bermanfaat."

University of Saint Louis baru saja mematenkan teknik baru dan saat ini sedang mencari komersialisasi.